tmp.pdb
tmp.out
     2 #duplex 
 177 # number of basepairs
     0 0  # expl bp numbering numbering / hetero atom
431 398
432 397
433 396
434 395
435 394
436 393
437 392
438 391
439 390
440 389
441 388
442 387
443 386
444 385
445 384
446 383
447 382
448 381
449 380
450 379
451 378
452 377
453 376
454 375
455 374
456 373
457 372
458 371
459 370
460 369
461 368
462 367
463 366
464 365
465 364
466 363
467 362
468 361
469 360
470 359
471 358
472 357
473 356
474 355
475 354
476 353
477 352
478 351
479 350
480 349
481 348
482 347
483 346
484 345
485 344
486 343
487 342
488 341
489 340
490 339
491 338
492 337
493 336
494 335
495 334
496 333
497 332
498 331
499 330
500 329
501 328
502 327
503 326
504 325
505 324
506 323
507 322
508 321
509 320
510 319
511 318
512 317
513 316
514 315
515 314
516 313
517 312
518 311
519 310
520 309
521 308
522 307
523 306
524 305
525 304
526 303
527 302
528 301
529 300
530 299
531 298
532 297
533 296
534 295
535 294
536 293
537 292
538 291
539 290
540 289
541 288
542 287
543 286
544 285
545 284
546 283
547 282
548 281
549 280
550 279
551 278
552 277
553 276
554 275
555 274
556 273
557 272
558 271
559 270
560 269
561 268
562 267
563 266
564 265
565 264
566 263
567 262
568 261
569 260
570 259
571 258
572 257
573 256
574 255
575 254
576 253
577 252
578 251
579 250
580 249
581 248
582 247
583 246
584 245
585 244
586 243
587 242
588 241
589 240
590 239
591 238
592 237
593 236
594 235
595 234
596 233
597 232
598 231
599 230
600 229
601 228
602 227
603 226
604 225
605 224
606 223