tmp.pdb
tmp.out
     2 #duplex 
 561 # number of basepairs
     0 0  # expl bp numbering numbering / hetero atom
17 772
18 771
19 770
20 769
21 768
22 767
23 766
24 765
25 764
26 763
27 762
28 761
29 760
30 759
31 758
32 757
33 756
34 755
35 754
36 753
37 752
38 751
39 750
40 749
41 748
42 747
43 746
44 745
45 744
46 743
47 742
48 741
49 740
50 739
51 738
52 737
53 736
54 735
55 734
56 733
57 732
58 731
59 730
60 729
61 728
62 727
63 726
64 725
65 724
66 723
67 722
68 721
69 720
70 719
71 718
72 717
73 716
74 715
75 714
76 713
77 712
78 711
79 710
80 709
81 708
82 707
83 706
84 705
85 704
86 703
87 702
88 701
89 700
90 699
91 698
92 697
93 696
94 695
95 694
96 693
97 692
98 691
99 690
100 689
101 688
102 687
103 686
104 685
105 684
106 683
107 682
108 681
109 680
110 679
111 678
112 677
113 676
114 675
115 674
116 673
117 672
118 671
119 670
120 669
121 668
122 667
123 666
124 665
125 664
126 663
127 662
128 661
129 660
130 659
131 658
132 657
133 656
134 655
135 654
136 653
137 652
138 651
139 650
140 649
141 648
142 647
143 646
144 645
145 644
146 643
147 642
148 641
149 640
150 639
151 638
152 637
153 636
154 635
155 634
156 633
157 632
158 631
159 630
160 629
161 628
162 627
163 626
164 625
165 624
166 623
167 622
168 621
169 620
170 619
171 618
172 617
173 616
174 615
175 614
176 613
177 612
178 611
179 610
180 609
181 608
182 607
183 606
184 605
185 604
186 603
187 602
188 601
189 600
190 599
191 598
192 597
193 596
194 595
195 594
196 593
197 592
198 591
199 590
200 589
201 588
202 587
203 586
204 585
205 584
206 583
207 582
208 581
209 580
210 579
211 578
212 577
213 576
214 575
215 574
216 573
217 572
218 571
219 570
220 569
221 568
222 567
223 566
224 565
225 564
226 563
227 562
228 561
229 560
230 559
231 558
232 557
233 556
234 555
235 554
236 553
237 552
238 551
239 550
240 549
241 548
242 547
243 546
244 545
245 544
246 543
247 542
248 541
249 540
250 539
251 538
252 537
253 536
254 535
255 534
256 533
257 532
258 531
259 530
260 529
261 528
262 527
263 526
264 525
265 524
266 523
267 522
268 521
269 520
270 519
271 518
272 517
273 516
274 515
275 514
276 513
277 512
278 511
279 510
280 509
281 508
282 507
283 506
284 505
285 504
286 503
287 502
288 501
289 500
290 499
291 498
292 497
293 496
294 495
295 494
296 493
297 492
298 491
299 490
300 489
301 488
302 487
303 486
304 485
305 484
306 483
307 482
308 481
309 480
310 479
311 478
312 477
313 476
314 475
315 474
316 473
317 472
318 471
319 470
320 469
321 468
322 467
323 466
324 465
325 464
326 463
327 462
328 461
329 460
330 459
331 458
332 457
333 456
334 455
335 454
336 453
337 452
338 451
339 450
340 449
341 448
342 447
343 446
344 445
345 444
346 443
347 442
348 441
349 440
350 439
351 438
352 437
353 436
354 435
355 434
356 433
357 432
358 431
359 430
360 429
361 428
362 427
363 426
364 425
365 424
366 423
367 422
368 421
369 420
370 419
371 418
372 417
373 416
374 415
375 414
376 413
377 412
378 411
379 410
380 409
381 408
382 407
383 406
384 405
385 404
386 403
387 402
388 401
389 400
390 399
391 398
392 397
393 396
394 395
395 394
396 393
397 392
398 391
399 390
400 389
401 388
402 387
403 386
404 385
405 384
406 383
407 382
408 381
409 380
410 379
411 378
412 377
413 376
414 375
415 374
416 373
417 372
418 371
419 370
420 369
421 368
422 367
423 366
424 365
425 364
426 363
427 362
428 361
429 360
430 359
431 358
432 357
433 356
434 355
435 354
436 353
437 352
438 351
439 350
440 349
441 348
442 347
443 346
444 345
445 344
446 343
447 342
448 341
449 340
450 339
451 338
452 337
453 336
454 335
455 334
456 333
457 332
458 331
459 330
460 329
461 328
462 327
463 326
464 325
465 324
466 323
467 322
468 321
469 320
470 319
471 318
472 317
473 316
474 315
475 314
476 313
477 312
478 311
479 310
480 309
481 308
482 307
483 306
484 305
485 304
486 303
487 302
488 301
489 300
490 299
491 298
492 297
493 296
494 295
495 294
496 293
497 292
498 291
499 290
500 289
501 288
502 287
503 286
504 285
505 284
506 283
507 282
508 281
509 280
510 279
511 278
512 277
513 276
514 275
515 274
516 273
517 272
518 271
519 270
520 269
521 268
522 267
523 266
524 265
525 264
526 263
527 262
528 261
529 260
530 259
531 258
532 257
533 256
534 255
535 254
536 253
537 252
538 251
539 250
540 249
541 248
542 247
543 246
544 245
545 244
546 243
547 242
548 241
549 240
550 239
551 238
552 237
553 236
554 235
555 234
556 233
557 232
558 231
559 230
560 229
561 228
562 227
563 226
564 225
565 224
566 223
567 222
568 221
569 220
570 219
571 218
572 217
573 216
574 215
575 214
576 213