tmp.pdb
tmp.out
     2 #duplex 
 541 # number of basepairs
     0 0  # expl bp numbering numbering / hetero atom
12 737
13 736
14 735
15 734
16 733
17 732
18 731
19 730
20 729
21 728
22 727
23 726
24 725
25 724
26 723
27 722
28 721
29 720
30 719
31 718
32 717
33 716
34 715
35 714
36 713
37 712
38 711
39 710
40 709
41 708
42 707
43 706
44 705
45 704
46 703
47 702
48 701
49 700
50 699
51 698
52 697
53 696
54 695
55 694
56 693
57 692
58 691
59 690
60 689
61 688
62 687
63 686
64 685
65 684
66 683
67 682
68 681
69 680
70 679
71 678
72 677
73 676
74 675
75 674
76 673
77 672
78 671
79 670
80 669
81 668
82 667
83 666
84 665
85 664
86 663
87 662
88 661
89 660
90 659
91 658
92 657
93 656
94 655
95 654
96 653
97 652
98 651
99 650
100 649
101 648
102 647
103 646
104 645
105 644
106 643
107 642
108 641
109 640
110 639
111 638
112 637
113 636
114 635
115 634
116 633
117 632
118 631
119 630
120 629
121 628
122 627
123 626
124 625
125 624
126 623
127 622
128 621
129 620
130 619
131 618
132 617
133 616
134 615
135 614
136 613
137 612
138 611
139 610
140 609
141 608
142 607
143 606
144 605
145 604
146 603
147 602
148 601
149 600
150 599
151 598
152 597
153 596
154 595
155 594
156 593
157 592
158 591
159 590
160 589
161 588
162 587
163 586
164 585
165 584
166 583
167 582
168 581
169 580
170 579
171 578
172 577
173 576
174 575
175 574
176 573
177 572
178 571
179 570
180 569
181 568
182 567
183 566
184 565
185 564
186 563
187 562
188 561
189 560
190 559
191 558
192 557
193 556
194 555
195 554
196 553
197 552
198 551
199 550
200 549
201 548
202 547
203 546
204 545
205 544
206 543
207 542
208 541
209 540
210 539
211 538
212 537
213 536
214 535
215 534
216 533
217 532
218 531
219 530
220 529
221 528
222 527
223 526
224 525
225 524
226 523
227 522
228 521
229 520
230 519
231 518
232 517
233 516
234 515
235 514
236 513
237 512
238 511
239 510
240 509
241 508
242 507
243 506
244 505
245 504
246 503
247 502
248 501
249 500
250 499
251 498
252 497
253 496
254 495
255 494
256 493
257 492
258 491
259 490
260 489
261 488
262 487
263 486
264 485
265 484
266 483
267 482
268 481
269 480
270 479
271 478
272 477
273 476
274 475
275 474
276 473
277 472
278 471
279 470
280 469
281 468
282 467
283 466
284 465
285 464
286 463
287 462
288 461
289 460
290 459
291 458
292 457
293 456
294 455
295 454
296 453
297 452
298 451
299 450
300 449
301 448
302 447
303 446
304 445
305 444
306 443
307 442
308 441
309 440
310 439
311 438
312 437
313 436
314 435
315 434
316 433
317 432
318 431
319 430
320 429
321 428
322 427
323 426
324 425
325 424
326 423
327 422
328 421
329 420
330 419
331 418
332 417
333 416
334 415
335 414
336 413
337 412
338 411
339 410
340 409
341 408
342 407
343 406
344 405
345 404
346 403
347 402
348 401
349 400
350 399
351 398
352 397
353 396
354 395
355 394
356 393
357 392
358 391
359 390
360 389
361 388
362 387
363 386
364 385
365 384
366 383
367 382
368 381
369 380
370 379
371 378
372 377
373 376
374 375
375 374
376 373
377 372
378 371
379 370
380 369
381 368
382 367
383 366
384 365
385 364
386 363
387 362
388 361
389 360
390 359
391 358
392 357
393 356
394 355
395 354
396 353
397 352
398 351
399 350
400 349
401 348
402 347
403 346
404 345
405 344
406 343
407 342
408 341
409 340
410 339
411 338
412 337
413 336
414 335
415 334
416 333
417 332
418 331
419 330
420 329
421 328
422 327
423 326
424 325
425 324
426 323
427 322
428 321
429 320
430 319
431 318
432 317
433 316
434 315
435 314
436 313
437 312
438 311
439 310
440 309
441 308
442 307
443 306
444 305
445 304
446 303
447 302
448 301
449 300
450 299
451 298
452 297
453 296
454 295
455 294
456 293
457 292
458 291
459 290
460 289
461 288
462 287
463 286
464 285
465 284
466 283
467 282
468 281
469 280
470 279
471 278
472 277
473 276
474 275
475 274
476 273
477 272
478 271
479 270
480 269
481 268
482 267
483 266
484 265
485 264
486 263
487 262
488 261
489 260
490 259
491 258
492 257
493 256
494 255
495 254
496 253
497 252
498 251
499 250
500 249
501 248
502 247
503 246
504 245
505 244
506 243
507 242
508 241
509 240
510 239
511 238
512 237
513 236
514 235
515 234
516 233
517 232
518 231
519 230
520 229
521 228
522 227
523 226
524 225
525 224
526 223
527 222
528 221
529 220
530 219
531 218
532 217
533 216
534 215
535 214
536 213
537 212
538 211
539 210
540 209
541 208
542 207
543 206
544 205
545 204
546 203
547 202
548 201
549 200
550 199
551 198