tmp.pdb
tmp.out
     2 #duplex 
 171 # number of basepairs
     0 0  # expl bp numbering numbering / hetero atom
353 350
354 349
355 348
356 347
357 346
358 345
359 344
360 343
361 342
362 341
363 340
364 339
365 338
366 337
367 336
368 335
369 334
370 333
371 332
372 331
373 330
374 329
375 328
376 327
377 326
378 325
379 324
380 323
381 322
382 321
383 320
384 319
385 318
386 317
387 316
388 315
389 314
390 313
391 312
392 311
393 310
394 309
395 308
396 307
397 306
398 305
399 304
400 303
401 302
402 301
403 300
404 299
405 298
406 297
407 296
408 295
409 294
410 293
411 292
412 291
413 290
414 289
415 288
416 287
417 286
418 285
419 284
420 283
421 282
422 281
423 280
424 279
425 278
426 277
427 276
428 275
429 274
430 273
431 272
432 271
433 270
434 269
435 268
436 267
437 266
438 265
439 264
440 263
441 262
442 261
443 260
444 259
445 258
446 257
447 256
448 255
449 254
450 253
451 252
452 251
453 250
454 249
455 248
456 247
457 246
458 245
459 244
460 243
461 242
462 241
463 240
464 239
465 238
466 237
467 236
468 235
469 234
470 233
471 232
472 231
473 230
474 229
475 228
476 227
477 226
478 225
479 224
480 223
481 222
482 221
483 220
484 219
485 218
486 217
487 216
488 215
489 214
490 213
491 212
492 211
493 210
494 209
495 208
496 207
497 206
498 205
499 204
500 203
501 202
502 201
503 200
504 199
505 198
506 197
507 196
508 195
509 194
510 193
511 192
512 191
513 190
514 189
515 188
516 187
517 186
518 185
519 184
520 183
521 182
522 181